Q. 도메인을 연결할 수 있었다면 서치콘솔 등록이 됐을까요?

A. 그래도 안 됩니다.
도메인은 겉옷일 뿐이고, 구글이 확인하는 것은 서버와 HTML의 제어권입니다.
도메인을 얹어도 서버·HTML의 주인은 여전히 네이버이므로 소유권 인증(HTML 태그 삽입)은 불가능합니다.